Za virus koji se širi nekoliko mjeseci i doseže više od 3 milijuna domaćina dugo je razdoblje evolucije i promjene. Neki virusi - poput gripe - mnogo mutiraju, što znači da moramo svake godine ažurirati cjepiva kako bismo ostali na zaštićeni tijekom širenja sezonske gripe. U međuvremenu, koronavirus koji je izazvao trenutnu pandemiju COVID-19 ostao je relativno stabilan, a čini se da mutira mnogo sporije od gripe. Ovo je sjajna vijest za razvoj cjepiva i za znanstvenike koji pomno proučavaju virus. Ali to ne znači da virus uopće ne mutira.
Nedavno su objavljene dvije nove studije koje analiziraju mutacije SARS-CoV-2. Jedno istraživanje s Državnog sveučilišta Arizona otkrilo je veliku deleciju DNA u uzorku virusa uzetom od pacijenta iz Tempe. Druga studija, koja još uvijek nije objavljena, rezultat je Nacionalnog laboratorija u Los Alamosu i pratila je mutacije tijekom cijele epidemije i ponudila hipotezu da je jedan sloj virusa zarazniji od izvornog sloja iz Wuhana.
Studija u Arizoni stvorila je tri cjelovita genoma SARS-CoV-2 iz niza uzoraka. Otkrili su da je jedan od tih genoma, kojeg su nazvali AZ-ASU2923, deletirao - 81 DNK bazni parovi - u genu zvanom ORF7a. ORF7a gen stvara dodatni protein koji pomaže virusu da zarazi, razmnoži se i širi se unutar ljudskog domaćina. Konkretno, smatra se da taj protein pomaže virusu da izbjegne naš imunološki sustav i ubije stanicu nakon završetka procesa replikacije. "Jedan od razloga zašto je ova mutacija zanimljiva je taj što ogledava veliko brisanje nastalo izbijanjem SARS-a 2003.", kaže jedan od istraživača, virolog Efrem Lim sa Sveučilišta Arizona.
Trenutno ne znamo kako bi ova mutacija promijenila koronavirus, a istraživači ga istražuju. Dosadašnja istraživanja sličnih gena i činjenica da su pronađeni samo u jednom pojedincu ukazuju na to da to brisanje vjerojatno nije sjajna vijest za virus. "Pojavljuju se slične delecije u genomima SARS-CoV-2, posebno u genu ORF8 koji potencijalno može smanjiti kondiciju virusa", piše tim u svom radu. "Kolektivni, iako globalni napori sekvenciranja sljedeće generacije, pokazuju da su genomi SARS-CoV-2 relativno stabilni, dinamičke mutacije mogu se odabrati u simptomatskim pojedincima."
U međuvremenu, druga studija koju je izradio tim iz Nacionalnog laboratorija u Los Alamosu dobila je značajno više medijske pažnje, unatoč činjenici da je trenutno u fazi prije objave pa stoga još nije provedena recenzija. Tim iz Los Alamosa stvorio je analizu cjevovoda za praćenje mutacija koje su viđene u koronavirusu, posebno one mutacije koje se odnose na zloglasni šiljasti protein na površini virusa. Tim je pronašao četrnaest mutacija koje se nalaze na šiljku, koje se gomilaju kako se virus širi. Ali jedna mutacija posebno zabrinjava istraživače. "Mutacijski šiljak D614G jako je zabrinjavajući. U Europi se počeo širiti početkom veljače, a kada se uvede u nove regije, brzo postaje dominantan oblik", piše tim u pre-printu. "Međutim, nije utvrđena značajna povezanost između statusa D614G i statusa hospitalizacije."
Sama mutacija je mnogo manja od one u Arizoni: riječ je o zamjeni jednog para baze DNK, iako je većina slučajeva također imala dvije pojedinačne zamjene u dva druga gena. Tim tvrdi da je mutacija proteina D614G, jer je mutacija proteina šiljka "prestigla" izvornu Wuhan verziju na mnogim lokacijama širom svijeta, postala zarazna i osjeća "hitnu potrebu za ranim upozorenjem" u slučaju da mutacija utječe na razvoj lijekova i cjepiva.
No, nisu se svi složili da je mutacija značajno promijenila sposobnost širenja virusa. "Velika većina sekvenciranih izolata potječe iz europske epidemije koja se proširila opsežnije od kineske", izjavio je za Gizmodo epidemiolog sa Sveučilišta Harvard Bill Hanage. "To bi moglo biti zato što je prenosnija, ali to može biti i zato što su relativno kasne intervencije dopustile da se širi više."
Kao i sve ostalo što ima DNK, virusi će polako mutirati dok stvaraju više kopija. Za SARS-CoV-2 do sada se procjenjuje da ima stopu manju od 25 mutacija godišnje, u usporedbi s 50 gripa. Većina mutacija je neutralna - naizgled ne čine ništa, dok su neke štetne, što će naštetiti virusu. Samo mali postotak svih mutacija blagotvorno djeluje na sam virus. Iako se rijetke, korisne mutacije događaju u svim vrstama organizama - otpornost na antibiotike u bakterijama jedan je takav primjer. Ali u ovom trenutku, samo ne znamo koja je vrsta mutacije D614G namijenjena virusu SARS-CoV-2.
Dobra stvar je što istraživači rade na tom slučaju i bez sumnje ćemo uskoro imati više informacija. Dakle, iako već opasan i vrlo zarazan mutiranje virusa zvuči nevjerojatno uznemirujuće, no nemojte previše stresirati. Virusi će mutirati, a koronavirus nije iznimka. Znanstvenici rade na tom slučaju. Studija u Arizoni objavljena je u časopisu Journal of Virology, a rad u Los Alamosu dostupan je na bioRxiv poslužitelju prije objave.
Izvor: Science Alert
